Зачем расшифровывать ДНК всей жизни на Земле? К работе приступил масштабный проект Earth BioGenome Project

Что известно об Earth Biogenome Project?

В начале века у нас было широкое понимание того, что большинство медицинских проблем в развитом мире частично обусловлено генетически, но не было технологий, чтобы полностью исследовать секреты, скрытые в нашем геноме.

Хотя у нас уже есть данные о геномах таких живых существ как мыши, плодовые мушки и нематоды, возможность изучать другие виды, которые могут работать немного иначе, дает огромное преимущество не только для науки.

В 2018 году команда ученых заявила, о запуске амбициозного проекта для секвенирования ДНК 1,8 миллиона видов растений, животных, грибов и микробных эукариот.

Теперь проект переходит от стадии запуска первой фазы, которая предполагает расшифровку геномов 9400 биосуществ. На данный момент в проекте завершено 200 геномов, и ожидается, что к концу 2022 года будет прочитана последовательность ДНК еще 3000, что уже составляет 34% первой фазы.

На втором этапе будет проведено секвенирование 180 тыс. живых существ, а на третьем этапе будет завершено определение всех видов.

В рамках проекта ученые всего мира объединяются для получения последовательностей геномов всех видов.

На данный момент в проекте участвуют более пяти тысяч исследователей из 22 стран на всех континентах, кроме Антарктиды.

В дополнение к научному подходу к секвенированию геномов, проект также включает комитеты по этике, правовым и социальным вопросам, это очень важно для разработки рекомендаций о том, как делиться этой уникальной информацией с остальным миром.

Есть надежда, что это может решить некоторые фундаментальные вопросы биологии, а также обеспечить прогресс в исследованиях и лечение многих болезней.

Какая цель проекта Earth Biogenome Project?

Еще не так давно секвенирование геномов было не только затратным в финансовом плане, но и относительно времени. В связи с техническими достижения этот процесс значительно упростился, теперь, чтобы расшифровать структуру ДНК, потребуется не миллионы долларов, а несколько тысяч, что также делает это проект вполне реалистичным для реализации.

Цель EBP, запущенной в ноябре 2018 года — предоставить полный каталог последовательностей ДНК всех 1,8 млн. названых видов растений, животных и грибов, а также одноклеточных эукариот.

История жизни на Земле несколько раз была подвержена событиям массового вымирания биоразнообразия, связанными с природными явлениями.

Сегодня многие эксперты предупреждают, что уже долгое время начался шестой кризис массового вымирания, и виной тому человек. По данным ученых Гавайского университета в Маноа (США) начиная с 16 века Земля потеряла более 260 тыс. видов — это 13% из двух миллионов известных видов.

Расшифровка генома живых существ еще один шаг к предотвращению исчезновения разнообразия экосистемы Земли.

Сравнение близких и отдаленно родственных видов дает возможность узнать, что делают гены и как они регулируются. Также есть шанс выявить новые данные по аномалиям в генах.

По прогнозам, уже в конце этого века с лица земли исчезнет почти половина всего биоразнообразия, если человечество не предпримет соответсвующее действия для предотвращения изменений климата. Создание цифровой базы последовательностей ДНК для всех известных эукариотических организмов может помочь создать эффективные инструменты для предотвращения утраты биоразнообразия, распространения патогенов и мониторинга и защиты экосистем.